SGE 输出会减慢我的模拟速度吗?如果会,会减慢多少?

我在我的大学使用集群是高性能计算设备,他们正在使用 SGE 系统来进行工作管理。 您可能会理解,默认情况下 SGE 将生成 2 个数据:NAME.oXXXXXNAME.poXXXXX。 我需要知道这个结果是否肯定会减少我的模拟。

通常我的模拟需要几周时间,而且 NAME.oXXXXX 文件会扩展得非常大,就像数 GB 一样,所以我有点担心这么大的文件肯定会减少我的模拟。

有没有人有任何类型的经验,如果有的话,如何将其转化。 真的我需要此结果日志来定期检查我的结果。

PS:我现在使用的存储不是 afs , 然而刮擦 ,所以没有使用 fsync

非常感谢!

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2022-06-07 14:42:01
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答案: 1

它取决于您写入日志的数量,但是我的猜测是每隔很多步骤它就是一行,所以您不必担心 - 大多数模拟通常会执行更多步骤(每个步骤都有数百个计算) 在写入日志行之间。

.oXXXX 结果数据是您的模拟计划的典型输出,肯定会联系到控制台或其他(.poXXXX 是“相同的结果”),因此写入它们的规律性取决于您的程序。 所以你写多少完全取决于你的模拟计划——描述它的手册来检查如何降低结果的频率,如果你能做到的话。 无论哪种情况,这对您的模拟速率的影响都必须最小。

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2022-06-07 15:11:45
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